按照《微生物和生物医学生物安全通用准则》WS2332002中的要求，其环境要求为十万级或者一万级，因此目前做出的设计，若采用十万级或一万级来设计，牵涉到的布置也各不相同，因此有必要作出比较明确的规定。本文建议如果在设置了负压P2实验室的情况下，P3应按照一万级设计较好，理由如下：
由于设置了P2实验室，在其范围内的实验和能分类但具体物质的性质未知或不太确定的的实验都可在其中进行，在一定程度上减少了P3实验室的使用频率，也可相应减少P3实验室的间数，节省运行费用和降低发生危险的频率，也为明确P3实验室的一万级净化级别打下基础。
能提高实验的准确性。虽然P3实验室测定的物质并不需要都有较高的空气净化要求，但有些实验由于环境的清洁程度会影响到实验的数据准确性。如测定某些病毒的活性和进行病毒的分类等。
由于十万级和一万级的净化要求不一样，布局也有区别。从一般环境到十万级只需经过一个气闸过程即可。但一般环境到一万级一般需要进过两个气闸。这对P3实验室的实验的安全性会更加有保障。
一般布置是：中间一个准备间，旁边围着数间P3的操作室，从准备室到操作室的进入，人员一般需要进过气闸，并将装有实验器材的密封容器，通过传递窗进出。建议在其中一间的物料出口设置双扉灭菌柜，用作在P3实验中较危险实验废弃物的预消毒。
安全出口：实验室布局中，根据安全消防规范要求，都要设置一定量的安全出口（逃生通道），目前常规设计都是按一般的安全门设置，在P3实验区和一般环境只设有一道门，如果万一发生危险，实验人员从安全门逃生，这样整个实验室的负压环境就会被破坏，造成有害物质的泄漏，造成较大的生物危害。所以在设置安全门时，应该再设置一个前室，在事故状态下，人员将被污染的衣服在前室脱下后，通过安全门逃出室外，同时双道门的设置也可以使实验室保持一定时间的负压，给事故处理留下一定的时间。
废弃物的处理：在实验室布置中，一般都是将废弃物装桶后，经过双扉灭菌器后离开实验区域。但对于需要以活体形式出来的实验物，如活的菌种等，就不能通过这种形式离开，建议采用通过装有消毒液贮槽的具有连锁装置和紫外线的传递柜离开。
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