化学实验室的通风方式有两种，即局部排风和全室通风。
局部排风是在有害物质产生后立即就近排出，这种方式能以较少的风量排走大量的有害物质，能量省而效果好，是改善现有实验室条件可行和经济的方法，也可能是适应新实验室通风建设的最好方式。实验室净化工程国家实验室代表国家最高水平，是按国际一流标准建立的，规模非常大，基本包括本学科领域所有研究方向，而且人员配备上要求面向国内外招聘最优秀的研究人员，直接参与国际竞争，往往是多学科交叉的创新平台。对于有些实验不能采用局部排风，或局部排风满足不了排风要求时，采用全室通风。
通风柜是实验室中最常用的一种局部（part)排风设备，他的性能好坏主要取决于通过通风柜空气移动的速度。影响正面速度和空气运动的因素是涡流、柜的入口形状、热载量、机械作用、排风孔设计和阻凝物等。此外，尚于他的防火能力、耐腐蚀性、是否便于清洗以及污染物进入排风系统前收集某些污染物的能力等性能有关。一般认为，实验室中的通风柜应能适应易燃的液体和气体，而且结构材料应具有几分钟的耐火能力，以保持通风柜的完整和及时将火封熄。
通风柜的排风系统可分为集中式和分散式两种。实验室设备实验脊椎动物生物安全防护实验室，其适用微生物范围与同级的一般生物安全防护实验室相同。
※【集中式】是把一层楼面或几层楼面的的通风柜组成一个系统，或者整个实验楼分成一二个系统。实验室净化工程结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于对健康成年人已知无致病作用的微生物，如用于教学的普通微生物实验室等。它的特性是通风机少，设备投资省，而且对通风柜的数量稍有增减，以及位置的变更，都具有一定的适应性。然而由于系统较大，风量不易平衡，尽管每个通风柜上都装有调节阀，但使用不方便，并且也不容易达到预定的效果。如果系统风管损坏需要检修时，那么整个系统的通风柜就无法使用。所以，原来采用集中式系统的实验室，先后都改为用分散式系统。
※【分散式】是把一个通风柜或同房间的几个通风柜组成一个排风系统。他的特点是：可根据通风柜的工作需要来启闭通风机，相互不受干扰，容易达到预定的效果，而且比集中式节省能源，因为集中式系统，只要一个通风柜在使用，就得开动大通风机。分散式由于系统小，排风量也小，阻力也小，所以通风机的风量、风压都不大，躁声与振动相应也较小。分散式还有一个特点，是对排出不同性质的有害气体易于处理。缺点是通风机的数量多、系统多，如果通风机集中于通风机房内，那么投资就会增大，如果通风机分散布置，而且就地安装，虽然通风机的投资增加，但风管的投资可节省，最后总投资不一定增大，建议使用分散式。
在划分系统(system)时，同一个房间内如有两个以上的通风柜，应划为一个系统，避免一个通风柜在使用，其他的通风柜产生倒流，使室内受到污染。同样，一个房间内除了一个排风系统外，不宜再装置其他排风设备。
排风系统的通风机，一般都装在屋顶上，或顶层的通风机房内，这样可不占用使用面积，而且使室内的排风管道处于负压状态，以免有害物质由于管道的腐化侵蚀 或损坏，以及由于管道不严密而渗入室内，此外，通风机安装在屋顶上或顶层的通风机房内，检修方便，易于消声或减振。
排风系统有害物质排放高度应按现行的《工业企业设计卫生标准》和《工业三废排放标准》执行。在一般情况下，如果附近五十米以内没有较高建筑物时，排放高度应超过建筑物最高处两米以上。
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