实验室医疗工艺流线主要包括工作人员流线、受检者流线和物品流线。
工作人员流线，宜通过一个清洁、更衣的空间进入办公生活区，工作时宜经过缓冲区域进入各实验室，工作人员进出实验区应有出入控制。 受检者流线一般仅限等候区和采样区，未经许可不得进入工作人员的工作区域。 物品流线一般包括送检样本流线、洁净物品流线和废弃物品流线。
物品流线需参考以下进行设计：
送检样本在采样和/或收样后，经过样本分析前程序处理后送入各检验用房。 洁净物品(包括实验用器具及药品等)通过专用通道运送后，存放在库房、冷库、药品库或无菌库等房间。 实验室生活垃圾应与医用垃圾分开处理，经过分类、消毒、打包后再由污物通道运送。
实验室工作流程包括样本分析前程序、样本分析、样本分析后程序三个步骤：
a) 样本分析前程序包括样本受理、准备、样品采集、处理、暂存；
b)样本分析包括检测、实验分析；
c)样本分析后程序包括检测结果确认、报告、样品保存、废弃物处理。
实验室生物安全应符合GB19489、WS 233的有关规定。实验室消防系统设置，应符合GB 50016、GB 50084、GB 50140、GB 50116、GB 51251的有关规定。
